То есть, примерно неделю назад расходуемый трафик по данным панели управления увеличился в десятки раз. Каких-то изменений на сайтах не проводилось и посещаемость тоже значительно не менялась.

Во первых, раньше было сказано, что трафик ISP manager не_равен трафику в VDS manager.

А теперь еще, в новых версиях VDS manager обнаружился массовый лаг с учетом трафа. Уже не первый раз такое вижу за ноябрь 2012.
Так вот, на будущее решил дать ответ на подобный вопрос. Процитурую слова какого-то чела.

По графикам в общем-то не совсем ясно направление трафика. Вам надо бы посмотреть tcpdump, убрав оттуда 80й порт, гляди насмотрите свои мегабиты вообще в DNS трафике, например. Для начала рекомендую вообще понять, есть ли у вас по факту этот трафик, это может сделать любая программа из разряда тех, которые отображают состояние и пропускную сетевых интерфейсов (для CentOS очень мне нравится iptraf, в FreeBSD можно посмотреть «netstat 1»). Вам надо вообще подтвердить, есть ли на вашем сервере трафик, потому что график со стороны провайдера, мало того что не может быть в принципе идентичный вашему, так еще и может просто быть криво составлен в ходе какого-то глюка, кто его знает.
Если трафик есть, например в iptraf его легко можно отфильтровать по портам и протоколам, с точки зрения мониторинга, что бы посмотреть что же это за трафик и куда \ откуда он поливается. Судя по тому, что у вас график имеет по оси Y всего 7 Mb/s полагаю, что вот то «начало» до всплесков, несло в себе 200-400 kb/s. Это весьма разные показатели и даже не в десятки раз как вы пишите, если с точки зрения посещения сайтов ничего не изменилось (в плане прироста посетителей) это какой-то аномальный трафик и вовсе может быть не ВЕБ трафик.